生物信息分析 生信分析難不難

生物信息學主要處理和分析哪些高通量數(shù)據(jù)類型，目前常用生物信息學分析方法有哪些，生物信息分析師都需要具備哪些技能，生物信息分析工程師是干什么的？做一單生物信息學分析需要多長時間，生信分析是什么意思？

本文導(dǎo)航

• 生物信息學入門必備基礎(chǔ)知識
• 生物信息學目前待解決的問題
• 生物工程師的就業(yè)前景
• 生物信息分析師怎么考
• 生命科學數(shù)據(jù)分析好就業(yè)嗎
• 生信分析難不難

生物信息學入門必備基礎(chǔ)知識

高通量數(shù)據(jù)類型主要包括基因芯片和基因測序，我估計你想知道的是具體的內(nèi)容。

具體的內(nèi)容其實是指的高通量測序技術(shù)的應(yīng)用，例如microarray，RNA-Seq，Exome-Seq，Target-Seq，Whole-genome-sequencing，宏基因組，16S RNA，microRNA，lncRNA測序等。

研究的問題就更五花八門了，像現(xiàn)在精準醫(yī)療的概念很火，主要是以基因測序為入口，后面的應(yīng)用，例如產(chǎn)前診斷，孕前診斷等，甚至像親子鑒定，腫瘤靶標等都可以通過生物信息學的分析手段來搞定。

生物信息分析分為幾個層次，第一個層次基本上就是用別人做好的成熟軟件，直接分析出你要的結(jié)果，再深入就是你會根據(jù)問題找到更合適的一些軟件或者模塊，自己組建一些分析流程，包括自己寫一些輔助的程序腳本，更深入的層次就是市面上沒有符合你要求的軟件或者統(tǒng)計算法，你依據(jù)自己的需求，定制自己的分析過程，自己從頭開始寫基礎(chǔ)程序，寫統(tǒng)計算法，寫模型等。到了這個程度就沒有那么多限制了，主要比的是個人的思維想法以及眼界開闊程度。

現(xiàn)在也很多生物信息的分析方法應(yīng)用在大數(shù)據(jù)的各個領(lǐng)域。本質(zhì)是各種統(tǒng)計思維方法的實現(xiàn)，找出特定的模式結(jié)果。

生物信息學目前待解決的問題

現(xiàn)在比較熱門的數(shù)據(jù)庫包括GEO、TCGA

GEO分析主要是芯片做差異分析，得到差異基因，差異基因可以做GO、KEGG功能富集分析

TCGA數(shù)據(jù)庫是癌癥分析的利器，可以做差異基因，差異miRNA，差異lncRNA，下載和整理臨床數(shù)據(jù)，做生存分析，高難度的COX分析

這兩個數(shù)據(jù)庫可以發(fā)到不錯的文章

生物工程師的就業(yè)前景

1. 計算生物學、統(tǒng)計學、機器學習、生物信息學等相關(guān)專業(yè)

2. 國內(nèi)畢業(yè)者需碩士學位或以上 （或國內(nèi)本科及兩年以上相關(guān)工作經(jīng)驗） / 海歸人員需國外的本科學位或以上

3. 熟悉Linux/Unix操作系統(tǒng)，有HPC環(huán)境背景優(yōu)先考慮

4. 熟悉生信流程創(chuàng)建

5. 精通PerI、R （如會Matlab、Python、C/C++中兩種以上編程語言可加分）

6. 具備較強的中英文文獻查詢與閱讀能力，并做英文書面報告

7. 精通單細胞、高通量測序數(shù)據(jù)的分析全流程者優(yōu)先考慮

生物信息分析師怎么考

生物學研究時，實驗下游的數(shù)據(jù)分析部分需要借助計算機編程、數(shù)學統(tǒng)計、現(xiàn)有軟件等手段來得到實驗結(jié)論。

生物信息工程師就是做這部分工作的，主要有分析思路的設(shè)計、實現(xiàn)等。

數(shù)據(jù)大多來源于dna測序儀，以及其他設(shè)備。

生命科學數(shù)據(jù)分析好就業(yè)嗎

做一單生物信息學分析需要至少半個小時。

生物信息學是在生命科學的研究中，以計算機為工具對生物信息進行儲存、檢索和分析的科學。是當今生命科學和自然科學的重大前沿領(lǐng)域之一，同時也將是21世紀自然科學的核心領(lǐng)域之一。

其研究重點主要體現(xiàn)在基因組學和蛋白質(zhì)組學兩方面，具體說就是從核酸和蛋白質(zhì)序列出發(fā)，分析序列中表達的結(jié)構(gòu)功能的生物信息。

生物信息學是在大分子方面的概念型的生物學，并且使用了信息學的技術(shù)，這包括了從應(yīng)用數(shù)學、計算機科學以及統(tǒng)計學等學科衍生而來各種方法，并以此在大尺度上來理解和組織與生物大分子相關(guān)的信息。

生物信息學的發(fā)展經(jīng)歷了3個階段：

第一個階段是前基因組時代。這一階段主要是以各種算法法則的建立、生物數(shù)據(jù)庫的建立以及DNA和蛋白質(zhì)序列分析為主要工作。

第二階段是基因組時代。這一階段以各種基因組計劃測序、網(wǎng)絡(luò)數(shù)據(jù)庫系統(tǒng)的建立和基因?qū)ふ覟橹饕ぷ鳌?/p>

第三階段是后基因組時代。這一階段的主要工作是進行大規(guī)?；蚪M分析、蛋白質(zhì)組分析以及其他各種基因組學研究。

以上內(nèi)容參考：百度百科--生物信息學

生信分析難不難

生信分析，意思如下：
生信分析是生物信息分析的意思。生物信息是反映生物運動狀態(tài)和方式的信息。遺傳密碼便是生物信息。自然界經(jīng)過漫長時期的演變，產(chǎn)生了生物，逐漸形成了復(fù)雜的生物世界。
生物信息分析師是具備生物學，計算機以及統(tǒng)計學知識，從事基因相關(guān)數(shù)據(jù)分析的專業(yè)人員。其工作內(nèi)容主要是通過綜合應(yīng)用現(xiàn)代分子遺傳技術(shù)、計算機技術(shù)、信息技術(shù)等學科知識，并結(jié)合分析對象特征，對數(shù)據(jù)進行序列比對、基因識別、變異檢測、蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)預(yù)測、基因表達等分析。